為什么新的致命性病毒很難被發現

在最近發表的一篇文章中，由MIPT研究人員組成的俄羅斯研究團隊是**系統地描述和總結了目前快速發展的病毒遺傳學領域的前沿技術。在過去的幾年中，已經開發出許多新的有效的病毒檢測方法，包括針對未知病原體的方法。作者將所謂的高通量下一代測序描述為一種有效的新方法。該方法有望徹底改變新的病原病毒的檢測和分析方法，但是將其引入主流臨床實踐至少要花費數年的時間。

為了應對COVID-19大流行的迅速蔓延，作者在《Virus》雜志上發表了有關識別和研究新興病原體（如冠狀病毒）的問題的基本綜述。

MIPT歷史遺傳學，放射性碳分析和應用物理實驗室的研究員，作者之一Kamil Khafizov說：“根據各種統計估計，有超過32萬種感染哺乳動物的病毒。但是到目前為止，只有不到1％的物種得到了研究。”

大多數病毒，包括引起人類呼吸道，消化系統疾病和其他疾病的病毒，仍未得到人類的研究，因此幾乎無法檢測。其背后的原因是現代測試系統針對的病毒范圍較窄。

但是，有一些新方法可能潛在地解決了檢測和識別新微生物的問題，并且本綜述探討了這些方法。作者認為下一代測序（NGS）是最有前途的，它可以并行分析多個DNA分子，無論是一組樣品，同一基因組的不同區域，還是兩者都可以。

“高效的數學算法是該方法的關鍵部分，” MIPT博士生兼評論的通訊作者Alina Matsvay說。 “它們使研究人員能夠將未知病毒的基因組與所有可用的病毒基因組參考進行比較，并預測其所有可能的特征，包括其致病潛力。”

NGS的主要缺點包括運行此類測試所需的設備和試劑的高成本以及冗長的樣品制備，測序和數據分析過程。這些限制，再加上對實驗室人員資格的高要求，使得該方法無法廣泛集成到主流臨床實踐中。然而，該技術的成本逐年下降，而其速度，準確性和效率卻在不斷增長。

作者指出，冠狀病毒大流行已證明NGS方法對于鑒定臨床樣品中的新病原體和研究病毒從動物向人類傳播的分子機制的重要性。該技術可能會在不久的將來獲得醫療保健方面的認證。