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胎牛血清RNA干擾了細胞培養外源性RNA

2016-10-08 15:11

注:在用胎牛血清培養細胞時,有沒有重視與對細胞培養FBS的RNA內容相關的生物學效應呢?想知道答案嗎?請繼續閱讀。

胎牛血清(FBS,已在真核細胞培養物被使用了幾十年。然而,很少受到人們的重視與對細胞培養FBS的RNA內容相關的生物學效應。在這里,用RNA測序,我們證明了FBS含有蛋白質編碼和調控RNA物種,包括基因,miRNA的,rRNA基因和的snoRNA的不同劇目。他們中的大多數(>70%),甚至在囊泡耗盡FBS(vdFBS)在細胞外囊泡(EV)和細胞間通訊的研究通常使用的準備擴展超速離心后保留。FBS的相關聯的RNA是共分離細胞培養物的細胞RNA(exRNA)和與下游RNA分析干擾。許多進化上保守的FBS衍生的RNA種類可以被錯誤地標注為人類或小鼠成績單。

值得注意的是,在FBS的豐富特定的miRNA,如的miR-122中,miR-451A和miR-1246,先前已為富集在細胞培養衍生的電動汽車,可能是由于胎牛血清的混雜影響的報道。公開可用的數據集exRNA分析支持FBS污染的概念。此外,FBS轉錄可通過培養的細胞吸收,并影響高度敏感的基因表達譜技術的結果。因此,對于實驗設計的預防措施是必要的,以減少因FBS衍生的RNA干擾和曲解。



通過培養細胞胞外囊泡(電動汽車)和脂蛋白復合物(的RNP)的形式發布外RNA(exRNA)的深度序列分析是研究一個擴展的領域。


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