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dPCR和qPCR之間的區別是什么?

2024-10-25 17:06

dPCR(數字PCR)和qPCR(實時熒光定量PCR)是兩種在分子生物學研究中廣泛使用的核酸定量技術,它們之間存在一些顯著的區別。以下是對這兩種技術的詳細比較:

一、檢測原理

1. qPCR:

o 主要使用插入染料(如SYBR Green)或熒光探針(如TaqMan)來監測整個擴增過程。

o 隨著PCR循環的進行,染料或探針的熒光強度逐漸增加,從而可以檢測到定量反應的DNA。

o qPCR依賴于標準品制備的標準曲線來確定未知樣品的濃度,因此是一種相對定量的方法。

2. dPCR:

o 將一個樣本分成大量的微小反應單元(通常是微滴或微孔),每個單元包含一個或多個拷貝的核酸分子。

o 每個單元都進行PCR擴增,并檢測擴增產物的熒光信號強度。

o 根據泊松分布原理以及陽性反應單元的比例,可以計算出起始模板DNA的濃度,因此dPCR是一種絕對定量的方法。

二、檢測流程

1. qPCR:

o 包括DNA提取、配置qPCR反應體系、加入DNA模板、設置反應條件及PCR擴增、讀取結果等步驟。

o 通常需要使用標準品生成標準曲線,以進行未知樣品的定量。

2. dPCR:

o 檢測流程與qPCR類似,但更強調樣本的精確分割和反應單元的獨立性。

o 包括DNA提取、濃度檢測并稀釋、配置PCR反應液、上機檢測、PCR擴增和結果判讀等步驟。

o dPCR的結果判讀通常依賴于對每個微小反應單元的熒光信號檢測,以及基于泊松分布的統計分析。

三、技術優勢與特點

1. qPCR:

o 具有高度的敏感性和特異性,能夠實現多重反應和自動化檢測。

o 實時熒光檢測模式功能強大,具備定性、定量、突變檢測等多種功能。

o 技術成熟,有大量商業化產品可供選擇,且價格相對較低。

o 更適合高通量分析,動態范圍寬。

2. dPCR:

o 準確度與精密度高,較少受到擴增效率的影響。

o 絕對定量,不需要標準品或標準曲線,直接計算樣品中目的核酸分子的個數。

o 抗干擾能力強,對抑制劑的抵抗能力高,適用于復雜樣本的檢測。

o 在微小差異面前表現優秀,能夠鑒別差異小于20%的拷貝數。

四、應用場景

1. qPCR:

o 廣泛應用于病原體檢測、基因表達分析、遺傳病診斷等領域。

o 在高通量篩選和大規模實驗中具有優勢。

2. dPCR:

o 適用于需要高精度和高靈敏度的實驗,如稀有突變檢測、基因拷貝數變異分析、無創產前檢測(NIPT)等。

o 在復雜樣本和抑制劑存在的情況下表現出色。

dPCR和qPCR在檢測原理、檢測流程、技術優勢與應用場景等方面存在顯著差異。研究人員應根據實驗需求、樣本類型和實驗條件等因素,選擇合適的技術進行核酸定量研究。