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Actin與GAPDH做內參區別

2024-06-07 15:36

ActinGAPDH作為內參在多個方面存在區別,以下將分別從定義、分布、作用、結構和應用等方面進行詳細闡述:

定義:

Actin(肌動蛋白):是細胞的一種重要骨架蛋白,分子量約為42kDa,基本上存在于所有真核細胞中。它作為內參是指為了衡量基因組數據的可靠性,使用序列保守性來測定從基因組中提取的某些基因的表達水平作為參考。

GAPDH(甘油醛-3-磷酸脫氫酶):是一個管家基因,在物種間是高度保守的。例如,人源的GAPDH335個氨基酸組成,其全長有70%Arabidopsis thaliana中由422個氨基酸組成的同源蛋白是相同的。GAPDHwestern blotPCR中都被用作參照。

分布:

Actin:主要分布于細胞骨架中,是細胞運動、維持細胞形態和細胞分裂的重要成分。

GAPDH:廣泛分布于各種組織中的細胞,存在于胞漿、細胞核、核周區及膜上。

作用:

Actinβ-ActinPCR常用的內參,其抗體也是Western Blot很好的內參指數。

GAPDH:被廣泛用作抽提total RNA,poly(A)+ RNA,Western blot等實驗操作的標準化的內參。但值得注意的是,缺氧可上調GAPDH的表達,導致GAPDH聚集,因此不能在涉及氧氣的相關研究中作為內參。

結構:

ActinGAPDH在分子結構和氨基酸序列上存在顯著差異,具體結構細節需要查閱相關生物學資料。

應用:

Actin:主要應用于生物化學與分子生物學、氨基酸、多肽與蛋白質、細胞生物學等領域。

GAPDH:除了作為內參用于實驗標準化外,其蛋白印跡法也常用于實驗分析中。

總結來說,ActinGAPDH作為內參在定義、分布、作用、結構和應用上均有明顯的區別。在選擇內參時,應根據實驗的具體需求和條件,綜合考慮這些因素,選擇最適合的內參。