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qPCR標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立步驟與原理

2024-05-23 15:20

qPCR(實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立步驟與原理如下:

步驟:

準(zhǔn)備標(biāo)準(zhǔn)樣品:首先需要準(zhǔn)備一系列已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)樣品。這些標(biāo)準(zhǔn)樣品可以是純化的DNARNA,也可以是含有目標(biāo)基因的質(zhì)粒。

測(cè)量標(biāo)準(zhǔn)樣品濃度:為了準(zhǔn)確測(cè)量標(biāo)準(zhǔn)樣品的濃度,可以使用比色法、熒光法或質(zhì)譜法進(jìn)行檢測(cè)。

制備標(biāo)準(zhǔn)曲線點(diǎn):一旦確定了標(biāo)準(zhǔn)樣品的濃度,就可以按照一定的稀釋比例制備一系列標(biāo)準(zhǔn)曲線點(diǎn)。在定量PCR實(shí)驗(yàn)中,通常會(huì)選擇一個(gè)稀釋系列,比如1:101:1001:1000等,這樣可以確保標(biāo)準(zhǔn)曲線的線性范圍覆蓋待測(cè)樣品中目標(biāo)基因的濃度范圍。

進(jìn)行PCR擴(kuò)增:將標(biāo)準(zhǔn)曲線點(diǎn)與待測(cè)樣品一起進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到擴(kuò)增曲線。

原理:

qPCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物。通過重復(fù)循環(huán)變性-退火-延伸三過程,可以獲得更多的半保留復(fù)制鏈,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。

在PCR擴(kuò)增過程中,熒光信號(hào)的變化可以實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè),并根據(jù)反應(yīng)時(shí)間和熒光信號(hào)的變化繪制成一條曲線。這條曲線通常包括三個(gè)階段:熒光背景信號(hào)階段、熒光信號(hào)指數(shù)擴(kuò)增階段和平臺(tái)期。在熒光信號(hào)指數(shù)擴(kuò)增階段,PCR產(chǎn)物量的對(duì)數(shù)值與起始模板量之間存在線性關(guān)系,因此可以通過檢測(cè)PCR產(chǎn)物的量來推斷模板最初的含量,從而實(shí)現(xiàn)定量分析。

在建立標(biāo)準(zhǔn)曲線時(shí),利用一系列已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)樣品進(jìn)行PCR擴(kuò)增,可以得到不同濃度下的擴(kuò)增曲線。通過分析這些曲線,可以建立一條以標(biāo)準(zhǔn)樣品濃度為橫坐標(biāo)、以某個(gè)特定循環(huán)數(shù)下的熒光信號(hào)值為縱坐標(biāo)的標(biāo)準(zhǔn)曲線。這條標(biāo)準(zhǔn)曲線可以用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)中待測(cè)樣品中目標(biāo)基因濃度的定量檢測(cè)。

總之,qPCR標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立是基于PCR擴(kuò)增原理和熒光信號(hào)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)技術(shù)的結(jié)合,通過利用已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)樣品進(jìn)行PCR擴(kuò)增并繪制擴(kuò)增曲線來建立標(biāo)準(zhǔn)曲線,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)對(duì)待測(cè)樣品中目標(biāo)基因濃度的定量檢測(cè)。