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qPCR(熒光定量PCR)實驗步驟

2024-03-07 16:32

qPCR實驗,即熒光定量PCR實驗,其步驟主要包括試劑耗材準備、RNA提取和反轉錄、體系配制以及上機操作。以下是詳細的步驟說明:

試劑耗材準備:確保實驗所需的八聯管和槍頭無酶無菌,鑷子提前進行高壓處理,加樣所用的金屬托架應提前放置在冰箱中降溫。

RNA提取和反轉錄:這一步需要在低溫條件下進行。使用Trizol進行RNA提取時,要注意蛋白質層的分離。Mix配置后應避免反復凍融,并注意防止空氣中的小片段核酸污染。RNA提取后應盡快進行反轉錄,不宜久放。

體系配制:在配制體系時,應確保在避光條件下進行。每個樣品應設置3個平行孔,以保證數據的真實性和可用性。如果同一樣本的核酸分裝在多個小EP管中,建議在配制體系時盡量將這些核酸轉移至一個管中混勻后再加樣,以保證平行孔間的數據穩定性。

上機操作:在上機前,應先對樣本進行離心處理。如果管內有氣泡,可以用手指輕彈以去除。加完樣后,樣本不能久置,應立即進行上機操作。

除了上述主要步驟外,實驗過程中還需要注意一些細節,如引物的設計。引物的設計應遵循一些原則,如擴增產物長度應在80-150bp之間,堿基應隨機分布,引物長度應在30-45bp之間,且5’端不應是G,因為G有淬滅作用,可能會影響定量結果。

另外,由于實時定量PCR實驗的靈敏度高,因此每個樣品至少需要做3個平行孔,以防止在后續的數據分析中由于Ct值相差較大或SD值過大而無法進行統計分析。

請注意,實驗的具體步驟可能因實驗目的、樣本類型以及所使用的試劑和儀器而有所不同。因此,在進行實驗前,建議仔細閱讀相關試劑和儀器的說明書,并遵循實驗室的操作規程。