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核酸法驗(yàn)證中支原體標(biāo)準(zhǔn)品

2022-05-13 12:12來(lái)源:威正翔禹|締一生物


支原體標(biāo)準(zhǔn)品

什么是支原體核酸法


支原體核酸法包括PCR和qPCR,通過(guò)檢測(cè)支原體的特異核酸序列,以確定細(xì)胞上清或生物制品中是否存在支原體污染的一種方法。


由于支原體核酸法具有檢測(cè)時(shí)間短(只需3-4h)、操作便捷等特點(diǎn),越來(lái)越受到生物制品企業(yè)的青睞。


支原體核酸法可作為藥典規(guī)定的培養(yǎng)法或DNA染色法的替代方法,或與以上方法相互補(bǔ)充。


事實(shí)上,早在2011年,就有動(dòng)物疫苗廠家在2011年第5期的《廣東農(nóng)業(yè)科學(xué)》上,報(bào)道了用德國(guó)Minerva Biolabs(簡(jiǎn)稱MB)公司的支原體PCR試劑盒,用于檢測(cè)疫苗中是否存在支原體的污染,它可與培養(yǎng)法互為補(bǔ)充,共同用于生產(chǎn),為生產(chǎn)提供可靠的數(shù)據(jù)支持。


支原體標(biāo)準(zhǔn)品

方法驗(yàn)證


支原體核酸法在用于放行檢測(cè)之前,需先進(jìn)行方法驗(yàn)證。歐洲藥典和日本藥典均要求核酸法需要在靈敏度、特異性和耐用性三個(gè)指標(biāo)方面達(dá)到要求。


在靈敏度方面(又稱最低檢測(cè)限),要求核酸法替代培養(yǎng)法,則靈敏度需達(dá)到10CFU/ml;核酸法替代DNA染色法,則靈敏度需達(dá)到100CFU/ml。

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在特異性方面,歐洲藥典和日本藥典要求,核酸法要識(shí)別指定的常見(jiàn)9種支原體,而不識(shí)別與支原體有近緣關(guān)系的菌屬,如丙酮丁醇梭菌、嗜酸乳桿菌和肺炎鏈球菌,也不識(shí)別其他細(xì)菌和哺乳動(dòng)物DNA。


在耐用性方面,歐洲藥典要求檢測(cè)結(jié)果不受方法參數(shù)的小的偏差的影響,如濃度的變化(MgCl2、引物、dNTP)、提取步驟的細(xì)微差別等。實(shí)際上這是強(qiáng)調(diào)結(jié)果的可靠性和穩(wěn)定性,不受人為操作誤差的影響。這可通過(guò)3輪不同時(shí)間段內(nèi)的檢測(cè)來(lái)實(shí)現(xiàn),每輪進(jìn)行8次重復(fù)檢測(cè),最后觀察結(jié)果有什么變化。


在進(jìn)行方法驗(yàn)證時(shí),參比標(biāo)準(zhǔn)品是必不可少的。世界**微生物防控專家德國(guó)MB公司提供有一系列的支原體標(biāo)準(zhǔn)品和支原體DNA標(biāo)準(zhǔn)品,用于支原體核酸法的方法學(xué)驗(yàn)證。

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支原體標(biāo)準(zhǔn)品

Minerva Biolabs標(biāo)準(zhǔn)品


MB提供的標(biāo)準(zhǔn)品有三類:


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靈敏度標(biāo)準(zhǔn)品


同時(shí)也用于耐用性驗(yàn)證。該標(biāo)準(zhǔn)品為凍干粉型的滅活支原體,這樣不會(huì)造成實(shí)驗(yàn)室污染。原支原體來(lái)自英國(guó)NCTC菌種保藏中心,由于傳代次數(shù)低,也很少發(fā)生突變。支原體經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)定量,有10CFU/管和100CFU/管可選。使用時(shí)用1ml與待測(cè)樣本同樣的基質(zhì)液去溶解。之后進(jìn)行支原體DNA抽提,再進(jìn)行核酸法檢測(cè)。如結(jié)果陽(yáng)性,則表明最低檢測(cè)限能達(dá)到上述標(biāo)準(zhǔn)。


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特異性驗(yàn)證用標(biāo)準(zhǔn)品

它包括支原體基因組DNA以及細(xì)菌基因組DNA,種屬經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證。該標(biāo)準(zhǔn)品為10ng左右包裝,為凍干粉型。用于PCR和qPCR方法對(duì)支原體物種的特異性檢查,每種支原體DNA經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證,濃度經(jīng)滴度測(cè)定


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PCR定量標(biāo)準(zhǔn)品

該標(biāo)準(zhǔn)品是經(jīng)過(guò)嚴(yán)格定量的支原體DNA標(biāo)準(zhǔn)品,每管支原體基因組DNA的量為1×10^8基因組拷貝,用于10倍梯度稀釋制備標(biāo)準(zhǔn)曲線,以對(duì)核酸法(主要是qPCR)的檢測(cè)限進(jìn)行精確定量,并可驗(yàn)證標(biāo)準(zhǔn)品濃度對(duì)數(shù)與Ct值的線性關(guān)系。


值得指出的是,歐洲藥典和日本藥典均要求先進(jìn)行支原體DNA抽提,再進(jìn)行核酸法檢測(cè)。因此,方法驗(yàn)證實(shí)際上包括了核酸法的這兩部分。


對(duì)于生物制品、細(xì)胞治療產(chǎn)品的生產(chǎn)企業(yè),在選用已經(jīng)過(guò)廠家全面驗(yàn)證的支原體檢測(cè)試劑盒之外,還需自己按照待測(cè)樣本類型進(jìn)行方法的適用性驗(yàn)證


試劑盒的驗(yàn)證并不能代替包括操作過(guò)程在內(nèi)的方法的適用性,操作、樣本基質(zhì)和儀器同樣會(huì)對(duì)核酸法的技術(shù)指標(biāo)產(chǎn)生不可忽視的影響。因此“對(duì)癥下藥”就顯得尤為重要了。


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