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m6A甲基化在免疫系統中的新發現2022-01-28 14:26來源:威正翔禹|締一生物
文獻速讀 大家晚上好! 本期的文獻速讀 我們來瀏覽一下 近期關于表觀遺傳的一項研究 在此之前 我們先來溫習兩個專有名詞 自然殺傷細胞(natural killer cell,NK): 是機體重要的免疫細胞,不僅與抗腫瘤、抗病毒感染和免疫調節有關,而且在某些情況下參與超敏反應和自身免疫性疾病的發生。一般認為NK細胞直接從骨髓中衍生,其發育成熟依賴于骨髓的微環境。NK細胞的殺傷活性無MHC限制,不依賴抗體。 m6A甲基化修飾: 甲基化,是指從活性甲基化合物上將甲基催化轉移到其他化合物的過程,可形成各種甲基化合物,或是對某些蛋白質或核酸等進行化學修飾形成甲基化產物。 N6-腺苷酸甲基化(m6A)是mRNA最常見的內部修飾之一。通俗點講,當腺苷酸的第六位N處發生甲基化時,就是我們所說的m6A。RNA的m6A甲基化一共有大三類酶參與: 甲基化轉移酶(Writers) 去甲基化酶(Erasers) 甲基化閱讀蛋白(Readers) m6A甲基化修飾調節mRNA的剪接、翻譯和穩定性,從而影響細胞的分化、增殖和凋亡。 m6A甲基化與NK細胞的關系 近年來,越來越多的科學家將目光投向免疫系統中,m6A甲基化修飾的作用。但是,該甲基化對NK細胞的影響和調控卻尚不清楚。 近日,有科研人員對此進行了研究。 研究結果表明: m6A“writer”METTL3在腫瘤浸潤的NK細胞中的表達下降,并且METTL3的蛋白表達水平與NK細胞中的效應分子呈正相關。 NK細胞中METTL3缺失會改變NK細胞的穩態,抑制NK細胞在腫瘤微環境中的浸潤和功能,導致小鼠腫瘤發展加速,生存期縮短。 編碼SHP-2的基因經過m6A修飾,其蛋白在METTL3缺失的NK細胞中表達減少。SHP-2活性的降低使NK細胞對IL-15的反應降低,這與mettl3缺失NK細胞中AKT和MAPK信號通路激活的抑制有關。 這些結果表明,m6A甲基化保護了NK細胞的穩態和腫瘤免疫監控功能。 實驗小結 該研究涉及到多個實驗,小鼠模型、細胞分離培養、細胞系構建、細胞純化、甲基化測定、免疫組化、ELISA、RT-qPCR、免疫印跡,mRNA-seq等。 其中細胞培養是基礎,RT-qPCR也是關鍵步驟之一。 細胞的培養離不開血清的支持,優質的血清在為細胞提供充足營養的同時,又可以**程度地減少外源的干擾,例如內毒素等對細胞有影響的物質。 Ausbian進口特級胎牛血清:
而像qPCR這樣精細的實驗,DNA污染很難徹底清除。即使只有一個污染的DNA分子被檢測到,也會使整個PCR檢測過程出現誤差。 為確保PCR試驗數據準確,預防DNA或RNA交叉污染,PCR實驗室大多會常備DNA/RNA污染清除劑。 德國Minerva Biolabs PCR Clean?:
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