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新發(fā)現(xiàn):RNA可變剪接在造血干細胞發(fā)生中的作用2022-01-12 16:03來源:威正翔禹|締一生物
RNA剪接(RNA splicing)是指從DNA模板鏈轉錄出的最初轉錄產物中除去內含子,并將外顯子連接起來形成一個連續(xù)的RNA分子的過程。 RNA剪接機制的研究 ,是80年代生物化學和分子生物學領域中最有生機的研究課題之一,它不僅解決不連續(xù)基因轉錄產物的剪接問題,而且對于了解不連續(xù)基因的起源乃至整個生命起源與進化問題都是有力的推動。 另外,核酸分子的催化功能的發(fā)現(xiàn)拓寬了人們對于酶的認識。 近日,發(fā)表在《Science Advances》上的一篇名為:“Single-cell architecture and functional requirement of alternative splicing during hematopoietic stem cell formation”的文章,揭示了造血干細胞發(fā)生過程中的RNA可變剪接。 **個造血干細胞(HSCs)產生于哺乳動物胚胎發(fā)育期間的主動脈-性腺-中腎(AGM)區(qū)域。血統(tǒng)追蹤和實時體內觀察表明,造血干細胞來自于造血內皮細胞(HECs),這是一種沿背主動脈腹壁的短暫群體。 最近,這些細胞被分離出來,并以單細胞轉錄組學為基礎,繪制了小鼠HSC發(fā)育全程的RNA剪接圖譜,并對內皮細胞向造血細胞的轉變(EHT)過程中,出現(xiàn)的關鍵可變剪接(alternative splicing, AS)及其上游調控因素進行探究,鑒定出Srsf2因子——通過調控造血細胞特異性AS事件促進HSC發(fā)生的新機制。 從AS角度解析T1 pre-HSC所呈現(xiàn)的最為顯著的轉錄本多樣性:
結果2 EHT期間轉錄異構體豐度的功能相關差異:
一系列AS事件介導了EHT中的轉錄多樣性:
血源特異性包括AS事件是可在體內檢測到的,是體外造血細胞生成所必需的。 Srsf2在內皮階段的缺失會破壞EHT。 Srsf2協(xié)調造血特異性AS事件:
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