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DNA和RNA復(fù)制變得簡單 通用等溫DNA擴增方法

2019-03-13 13:30來源:生物幫



無論是揭示具有DNA證據(jù)的犯罪者,診斷病原體,對古生物學(xué)發(fā)現(xiàn)進行分類,還是確定親子關(guān)系,核酸的重復(fù)(擴增)都是必不可少的。

在Angewandte Chemie期刊中,科學(xué)家們現(xiàn)在推出了一種新的,非常簡單但高度靈敏且可靠的方法,避免了通常的加熱和冷卻步驟,以及復(fù)雜的儀器。試劑可以冷凍干燥,這種通用方法可以在實驗室外使用。


最常用的擴增方法是聚合酶鏈反應(yīng)(PCR),它基于對功率需求高的特殊儀器中多次熱循環(huán)的重復(fù)。例如,難以在實驗室外,患者床邊或遠程位置執(zhí)行。沒有熱循環(huán)的替代方法通常是復(fù)雜的或不夠靈敏,需要昂貴的試劑,或者不是廣泛適用的。


與中國上海華東理工大學(xué)的Bin-Cheng Yin和Bang-Ce Ye合作的研究人員現(xiàn)已開發(fā)出一種新的,廉價的方法:稱為基于Cas9n的擴增反應(yīng)(Cas9nAR),它由一個單一組成在均相溶液中進行,并在37℃的恒定溫度下進行。


在這種方法中,研究人員使用來自細(xì)菌“免疫系統(tǒng)”的成分。例如,當(dāng)細(xì)菌被病毒感染時,它們將外來遺傳物質(zhì)切成小塊并將它們引入它們自己基因組的特定區(qū)域。在隨后感染的情況下,細(xì)菌的RNA鏈“識別”這些序列并指導(dǎo)特殊的“遺傳剪刀”來切割外源DNA。這些工具也被用于現(xiàn)代基因工程。


Yin,Ye和他們的同事改變了稱為Cas9的遺傳剪刀,使其不再完全切斷DNA。相反,它只穿過一條線,引入了“缺口”。這種酶被稱為“切口酶”。與細(xì)菌系統(tǒng)一樣,Cas9切口酶與RNA鏈結(jié)合,這決定了切口的位置。例如,可以制備該RNA,使其識別病原體特征的DNA序列。然后Cas9切口酶切割緊鄰的DNA。


對于這項新技術(shù),研究人員制作了兩種不同的Cas9切口酶RNA復(fù)合物,它們在兩個不同的位置切割DNA。通常用于PCR的聚合酶(exo(?)Klenow聚合酶)從**個切口開始補充切割鏈,逐條地設(shè)置舊鏈,直到它到達第二個切口。新完成的DNA被切口酶復(fù)合物反復(fù)切口并補充。該過程釋放的短單鏈成為在第二個循環(huán)中進一步擴增的起點。除了切口酶復(fù)合物和聚合酶之外,**需要的是兩個合適的引物作為拷貝的起始點。


用細(xì)菌基因組DNA片段進行的測試表明,靶序列被精確識別和擴增。在20μl的體積中,可以檢測單個分子。可以以高特異性檢測基因內(nèi)單個核苷酸的差異。