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深度學(xué)習(xí)可以預(yù)測細(xì)胞外觀,幫助發(fā)現(xiàn)病變過程

2017-04-12 09:18

每個細(xì)胞都是不同的理論填補(bǔ)空白

在接下來的幾個月中,艾倫研究所的研究人員將更新處于不同的分裂階段的細(xì)胞圖像,比如細(xì)胞分化成如心臟和腎臟細(xì)胞時。Horwitz說,捕獲不同時間點的圖像,對于確定基本的細(xì)胞發(fā)育過程至關(guān)重要。

艾倫研究所著眼于干細(xì)胞圖片研究,與一些其他機(jī)構(gòu)試圖將細(xì)胞的其他方面進(jìn)行分類相契合。例如,英國倫敦的慈善機(jī)構(gòu)英國癌癥研究Cancer Research UK)正在創(chuàng)建腫瘤中乳腺癌細(xì)胞的互動虛擬現(xiàn)實模型。而另一個國際性的合作組織人類細(xì)胞圖譜   Human Cell Atlas)正試圖根據(jù)其分子譜(包括DNA序列,RNA轉(zhuǎn)錄物和蛋白質(zhì))定義所有人類細(xì)胞類型。

Aviv Regev是馬薩諸塞州劍橋Broad研究所的計算生物學(xué)家,他正在致力于人體細(xì)胞圖譜,他指出,AllenCell Explorer關(guān)注細(xì)胞外觀形態(tài)特征,而她的項目關(guān)注基因,RNA和蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)相互作用,這樣正好互為補(bǔ)充。她表示:科學(xué)社區(qū)直到最近才認(rèn)可這個事實,即我們以前認(rèn)為相同的細(xì)胞,之間存在很多差異,她說,所以現(xiàn)在我們正在采取一種不偏不倚的方式,來了解這個拼圖的每一塊局部,而以前,我們都不知道它的存在。

AllenCell Explorer網(wǎng)站的推出,將是艾倫細(xì)胞科學(xué)研究所與全球科學(xué)界共享圖像數(shù)據(jù)和預(yù)測模型的平臺,這個開放數(shù)據(jù)的門戶網(wǎng)站將使研究人員能夠提出關(guān)于細(xì)胞變異性的重要新問題,以及它們?nèi)绾巫兓只蛻?yīng)對藥物的變化。 作為一個社區(qū),科學(xué)家可以一起應(yīng)用和擴(kuò)展這些工具,在細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域取得飛躍,造福人類的健康和疾病研究。


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