利用微生物培養基的景觀來預測新的有機體媒體配對

KOMODO的內容被示出:

（a）該數據庫的結構，示出主要表和信息點如何連接的地圖。

（b-d）的生物體，培養基和營養成分存在于數據庫中的號碼。種子是指模型種子數據庫16;看到KOMODO網站和方法的更多細節。

KOMODO揭示了媒體和復合使用全球格局

在KOMODO媒體使用和組成的典型模式可以揭示微生物營養的基本趨勢，以及差距和調查偏見。為了獲得這些關系的概述，我們建部分，媒體和生物分布直方圖整個數據庫（圖2a-d）。我們觀察到整個生物體跨越媒體組件使用，和介質的使用都遵循冪律，這表明一個'富人變得更加富有“結構表型和元件用途的分配（圖2a，2b）。這種結構可能反映了趨同生物體之間的營養需求，在這種“成功”的媒體選擇了人類調查，或兩者生物體的優惠方式。

（a）在媒體組件的分布。這包括定義和復雜/不確定的成分，其中，不確定的成分被分組到其復雜的類別和各類別中存在的培養基計為一個組件。

（b）由生長在這些生物的多家媒體分布。

（c）生物體生長在媒體的數量分布。

（d）使它們內部組件的數目的媒體分布。知名媒體的的pH值分布。

（e）紅色方塊A和B表示用于功法配合垃圾箱。

（f）跨屬40個最常用的媒體組件。此處列出離子典型地加入到媒體鹽，其中我們假設完全離解在溶液中（例如，MgCl2的變為鎂2+和Cl-）。

組件被分成四組：生物常見離子/化合物，微量金屬/準金屬，維生素/輔酶等。在每個組中，組件被他們跨越屬使用頻率的順序排列，從多到少。留下的條形圖是平均濃度橫跨KOMODO在媒體的每個組件的，在日志10（摩爾濃度）為單位列出的列表。組件是屬'差'，如果它出現在媒體在該屬一些菌株，而不是其他。